ไขคดีวิกฤตการณ์เรือรบ พลิกผันชี้ชะตา แผ่นดินญี่ปุ่น

เรือลึกลับไม่ทราบสัญชาติลำหนึ่งซึ่งบรรทุกระเบิดมาด้วย ผุดขึ้นเหนือทะเลอรุณรุ่ง และนั่นคือจุดเริ่มต้นของเรื่องทั้งหมด…ไกลออกไปนอกท่าเรือไมซึรุ เกียวโต กองกำลังป้องกันตนเองทางทะเลจัดกิจกรรมทัศนศึกษาล่องเรืออีจิส ซึ่งเป็นเรือรบมูลค่ามหาศาล "โคนัน" "รัน" "โคโกโร่" และเหล่าเด็กขบวนการนักสืบจิ๋วต่างก็ตื่นตาไปกับสรรพาวุธล้ำสมัยของเรือรบทรงแสนยานุภาพทว่าบัดนั้นเองก็มีเสียงดังกึกก้องสะท้าน บรรยากาศแห่งความพรั่นพรึงแผ่กระจายอยู่ในเรือ! หรือว่านั่นจะเป็นศพของเจ้าหน้าที่กองกำลังป้องกันตนเอง! มีจุดที่น่าสงสัยไม่น้อยหลงเหลืออยู่…โคนันกระโจนเข้าสู่การสืบสวนพบว่ามีสายลับ “X” จากต่างประเทศปะปนอยู่บนเรือด้วยสายลับ “X” คือใคร? เกี่ยวข้องอะไรกับเรือไม่ทราบสัญชาติ ? เงาของสายลับที่สะกดรอยตามพวกโคนัน…นี่คือเที่ยวเรือที่ซุกซ่อนอุบายร้ายอันจะสั่นสะเทือนญี่ปุ่นทั้งประเทศอย่างเหนือยิ่­งกว่าความคาดหมายใด ๆ !