หลังจากการสู้รบด้วยหุ่นจักรกล ระหว่างหุ่น "มาชินก้า Z" ที่ขับเคลื่อนโดย "โคจิ" เด็กหนุ่มม.ปลายเลือดร้อน กับหุ่นยักษ์ของ “ด๊อกเตอร์เฮล” นักวิทยาศาสตร์ผู้ชั่วร้ายหมายจะครองโลก เวลาผ่านไป โคจิกลายเป็นนักวิทยาศาสตร์หนุ่มอนาคตไกล วันหนึ่งได้มีการขุดพบหุ่นยักษ์ที่ใหญ่กว่ามาชินก้าหลายสิบเท่า โคจิตั้งชื่อหุ่นตัวนี้ว่า “มาชินก้า อินฟินิท” จักรกลที่น่าเกรงขามที่สุดเท่าที่เขาเคยพบ และที่นั่นเขาก็ได้เจอกับสาวน้อย “ลิซ่า” ผู้ที่กุมความลับของพลังอันไร้ขีดจำกัดของหุ่นยักษ์ตัวนี้ แต่ทว่าหลังจากนั้นไม่นานนัก ดร.เฮล และลูกสมุนก็กลับมาจากความตาย และตรงดิ่งมาที่สถาบันวิจัยเพื่อชิงเอามาชินก้า อินฟินิทตัวนี้เพื่อแผนการครองโลก โคจิที่วางมือจากการขับหุ่นยักษ์พิทักษ์โลก จึงต้องกลับมาอีกครั้ง แม้ว่าในใจของเขาจะเต็มไปด้วยความสงสัย คำถามคาใจ และความสัมพันธ์กับคนรอบตัว