เรื่องราววุ่นๆ จากการหนีออกจากบ้านของโนบิ­ตะ ได้นำไปสู่การผจญภัยครั้งใหญ่ออันเป็นต้นเหตุข­องการกำเนิดประเทศญี่ปุ่น ซึ่งนอกจากโนบิตะแล้ว เหล่าเพื่อนๆ ไม่ว่าจะเป็น ไจแอนต์ ซึเนโอะ ชิซึกะ และ โดราเอมอน ต่างก็อยากหนีออกจากบ้านด้วย แต่ว่าปัญหาคือญี่ปุ่นในยุคปัจจุบัน ไม่มีที่ดินว่างจะให้หนีไปอยู่อาศัยแล้ว พวกโนบิตะจึงตัดสินใจย้อนอดีตไปยังญี่ปุ่น­ยุค 70,000 ปีก่อนคริสตกาล