โนบิตะและเพื่อนๆ อยากเที่ยวผจญภัยในช่วงปิดเทอมฤดูร้อน โนบิตะและโดราเอมอนจึงค้นหาสถานที่ลึกลับที่ยังหลงเหลือบนโลก ระหว่างนั้นโนบิตะได้พบเจอกับสุนัขข้างทางตัวหนึ่งและได้เก็บมาเลี้ยง โดยตั้งชื่อมันว่า "เปโกะ" และเจ้าเปโกะนี่เองที่ช่วยค้นหาสถานที่ลึกลับจนเจอ ซึ่งเป็นที่ ๆ มีรูปปั้นสุนัขปริศนาตั้งอยู่กลางป่าลึกในแอฟริกา โนบิตะและเพื่อนๆ จึงได้เริ่มการออกผจญภัยและไขปริศนาของรูปปั้นเทวรูปสุนัขยักษ์ในป่าลึกให้จงได้