ในโลกอนาคตอีก 400 ปีข้างหน้า เมื่อประชากรโลกถูกทำลายล้างจนเกือบหมดด้วยโรคร้าย เหลือแต่ประชากรในเมืองเบรคน่ซึ่งปกครองโดยคณะนักวิทยาศาสตร์ ทางด้าน "อิออน ฟลัคซ์" (ชาร์ลิซ เธอรอน) เธอคือสุดยอดมือสังหารของกลุ่มกบฏใต้ดิน "โมนิกัน" ซึ่งได้ถูกส่งตัวไปสังหารผู้นำในคณะรัฐบาล แต่เธอกลับได้ค้นพบความลับที่พลิกโฉมหน้าโลกใบนี้ไปอย่างคาดไม่ถึง